本发明涉及一种多疏水结构的船用热力系统,包括辅汽轮发电机组、辅冷凝器、旁排系统,所述辅汽轮发电机组具有抽气器疏水接口、主蒸汽疏水接口、主汽门疏水接口、前汽缸疏水接口、汽封补汽疏水接口,所述旁排系统中设置有多级减温减压装置,一、二级减温减压装置均由“减压阀+减温器”的形式组成,各级减温减压装置的减压比匹配疏水压力,即各级减温减压后的蒸汽压力小于排入该段管路中疏水的压力。本发明优化了船用汽轮发电机组不同压力等级蒸汽疏水需引至各压力容器的复杂系统,有效减小了设备所占空间,同时高温疏水通入冷凝器中有利于凝水的热力除氧,提高了整个循环系统经济性;并可快速稳定蒸汽管网压力,有利于蒸汽系统安全性。