本发明公开了一种CRISPR/Cas9基因编辑系统及其在制备治疗遗传性感音神经性聋的药物中的应用,所述的基因编辑系统包括特异性靶向Myo6~(C442Y)突变基因的gRNA以及SaCas9-KKH,并通过AAV-PHP.eB病毒载体递送,形成了有效的针对Myo6~(C442Y)的敲除系统。本发明通过Myo6~(WT/C442Y)小鼠模型实验,评价其对小鼠听力损失的影响,结果发现AAV-SaCas9-KKH-Myo6-g2系统能特异性地敲除Myo6~(WT/C442Y)小鼠中的Myo6~(C442Y)突变等位基因,且Myo6~(WT/C442Y)小鼠中注射AAV-SaCas9-KKH-Myo6-g2后可在长达5个月的时间内,观察到听觉功能的恢复,同时,还观察到ABR I波潜伏期变短、细胞存活率提高、纤毛形态变规则,直观地验证了AAV-SaCas9-KKH-Myo6-g2系统对Myo6~(C442Y)突变基因导致的半显性遗传感音神经性聋的治疗作用,可用于制备治疗半显性遗传感音神经性聋的药物。